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洋蔥為二年生或多年生草本。根弦線狀，濃綠色圓筒形中空葉子，表面有蠟質；葉鞘肥厚呈鱗片狀，密集于短縮莖的周圍，形成鱗莖（俗稱蔥頭）；傘狀花序，白色小花；蒴果。根莖外邊包著一層薄薄的皮（白、黃或紅色），里面是一層一層的肉，一般是白色或淡黃色。

洋蔥的胚根入土后不久便會萎縮，因而沒有主根，其根為弦狀須根，著生于短縮莖盤的基部，根系較弱，無根毛，根系主要密集分布在20cm的表土層中，故耐旱性較弱，吸收肥水能力能力較弱。根系生長溫度較地上低，地溫5攝氏度時，根系即開始生長，10～15攝氏度最適，24～25攝氏度時。 

洋蔥的莖在營養(yǎng)生長時期，莖短縮形成扁圓錐形的莖盤，莖盤下部為盤踵，莖盤上部環(huán)生圓圈筒形的葉鞘和枝芽，下面生長須根。成熟鱗莖的盤踵組織干縮硬化，能阻止水分進入鱗莖。因此，盤踵可以控制根的過早生長或鱗莖過早萌發(fā)，生殖生長時期，植株經受低溫和長日照條件，生長錐開始花芽分化，抽生花薹，花薹筒狀，中空，中部膨大，有臘粉，頂端形成花序，能開花結實。頂球洋蔥由于花期退化，在花苞中形成氣生鱗莖。